تم تأسيس. مستشفى ابن سينا بسبب الطبيب الانساني دكتور زاكي الدين الذي انقذ حياة زوجة السفير الياباني التي أصيبت بمرضي مفاجئ وهو عبارة عن آلم حاد أصاب معدتها ، حيث إنطلق بها زوجها السفير لمستشفي بحري ، وطلب من الطبيب زاكي الدين أن يتكرم بعمل ما يلزم حتي تعود صحة زوجته كما كانت . ونصحه الطبيب بضرورة إجراء جراحة عاجلة لزوجته في هذا المستشفي المتواضع ، وقبل السفير بهذا الخيار مجبورا رغم سوء اوضاع مستشفى بحري في ظل معاناة زوجته من المرض. وتم إجراء العملية لإبنة الإمبراطور والتي تكللت بالنجاح الامر الذي يؤكد علي شطارة الطب السوداني ، وخرجت تمشي علي رجليها . السفير طار بزوجته إلى اليابان ، ومن المطار إلى أضخم مستشفى في اليابان .. فهي ابنة اﻻمبراطور وهناك اخضعوا زوجة السفير والجراحة نفسها للفحوصات . بعد ساعتين كانت مجموعة اﻷطباء تقول للسفير : أين أجريت لها هذه العملية؟ ومن قام بها ؟ قال : في بلد اسمه السودان ، وطبيب اسمه زاكي الدين ، فقالوا له هذا طبيب معجزة . وإن هذه العمليه ما كان لها أن تنجح لخطورتها وﻻبد من دعوة هذا الطبيب للحضور لليابان لمناقشته . ثم جاءت الدعوة للبروفيسور زاكي الدين من اﻻمبراطور نفسه والد زوجة السفير ، وهناك بعد مناقشته يسألونه : ماذا تتمنى,أطلب أي شي قال : لا أطلب شي لنفسي بل أطلب بناء مستشفى حديث للسودان . وكان هذا المستشفي هو مستشفي إبن سينا والذي يقع في وسط العاصمة الخرطوم ، والذي يعد من أشهر المستشفيات في العاصمة . لمستشفى ابن سينا التخصصي قسم لأمراض الجهاز الهضمي والكلى والمسالك البولية بمحلية الخرطوم، وفي العام 2019م اكتمل انشاء تخصص المخ والأعصاب رقم الهاتف:- 0024925667967 00249922325114